※以下、本編の大まかな流れのネタバレがあります。

高校生探偵が、小さな名探偵・江戸川コナンに!?
1996年1月8日、アニメ放送開始!
高校生探偵・工藤新一は黒ずくめの男に薬を飲まされ小学生の体になってしまった。「江戸川コナン」として難事件に挑みながら組織を追う!
アニオリの出来事…アニオリ初の回は6話「バレンタイン殺人事件」。初期の脚本は劇場版の脚本でおなじみの古内さん・初期から現在まで多くの回を手掛ける宮下さんが多め。小五郎や蘭が出てくる回は原作の雰囲気に近く、探偵団の回はコミカルで元気です。
- 監督:こだま兼嗣
- OP:胸がドキドキ/ザ・ハイロウズ(1〜30話)Feel Your Heart/VELVET GARDEN(31〜52話)
- ED:STEP BY STEP/ZIGGY(1〜26話)迷宮のラヴァーズ/heath(27〜51話)

増える難事件!西の探偵や怪盗と対決!
43話「江戸川コナン誘拐事件」で工藤夫妻、48・49話「外交官殺人事件」で西の高校生探偵・服部平次、76話「コナンVS怪盗キッド」で月下の奇術師・キッドなどが続々登場。
アニオリの出来事…66話「暗闇の道殺人事件」でアニオリから誕生した高木刑事が初登場!後に原作に逆輸入され登場。4月には初の劇場版が上映。
- 監督:こだま兼嗣
- OP:Feel Your Heart/VELVET GARDEN(31〜52話)謎/小松未歩(53〜96話)
- ED:迷宮のラヴァーズ/heath(27〜51話)光と影のロマン/宇徳敬子(52〜70話)君がいない夏/DEEN(71〜83話)
- 劇場版:「時計じかけの摩天楼」

事件の裏の黒い影。暗躍する女性の正体は――
蘭に正体がバレそうになり、有希子に助けられる96話「追いつめられた名探偵! 連続2大殺人事件」、服部の幼馴染・遠山和葉初登場の118話「浪花の連続殺人事件」などが放送。
アニオリの出来事…アニメ13話で未登場になっていた宮野明美と組織関連の整合性をとるため、128話「黒の組織10億円強奪事件」放送。事件自体はアニメオリジナル。
- 監督:こだま兼嗣、山本泰一郎(119話〜)
- OP:謎/小松未歩(53〜96話)運命のルーレット廻して/ZARD(97話〜123話)
- ED:願い事ひとつだけ/DEEN(84〜108話)氷の上に立つように/DEEN(109〜131話)
- 劇場版:「14番目の標的」

組織から来た謎の女、その名はシェリー
129話「黒の組織から来た女 大学教授殺人事件」で灰原哀が、153・154話「園子のアブない夏物語」で蹴撃の貴公子・京極真が登場。飛行機内で新一と蘭が事件に遭遇する162話「空飛ぶ密室 工藤新一最初の事件」なども放送。
アニオリの出来事…このシーズンはサスペンス調のものが多め。135話「消えた凶器捜索事件」で灰原がアニオリ初登場。
- 監督:山本泰一郎
- OP:TRUTH〜A Great Detective of Love〜/TWO-MIX(124〜142話)ギリギリchop/B’z(143〜167話)Mysterious Eyes/GARNET CROW(168〜204話)
- ED:氷の上に立つように/DEEN(109〜131話)Still for your love/小松未歩(132〜152話)Free Magic/WAG(153〜179話)
- 劇場版:「世紀末の魔術師」

工藤新一、ついに復活――!
杯戸シティホテルで組織のメンバー・ピスコと接触する176〜178話「黒の組織との再会」、コナンが洞窟で銃弾に倒れ、一時的に新一として復活する188〜193話「命がけの復活」放送。目暮警部が帽子をかぶっている理由が明らかに!217・218話「封印された目暮の秘密」なども。
アニオリの出来事…ボリュームたっぷりの作りこまれた前後編が多め。
- 監督:山本泰一郎
- OP:Mysterious Eyes/GARNET CROW(168〜204話)恋はスリル、ショック、サスペンス/愛内里菜(205〜230話)
- ED:Free Magic/WAG(153〜179話)Secret of my heart/倉木麻衣(180〜204話)夏の幻/GARNET CROW(205〜218話)
- 劇場版:「瞳の中の暗殺者」

近づく組織の気配。灰原の運命は?
まじっく快斗のエピソード「ブラック・スター」とコナンの「黄昏の館」での事件を合体した219話「集められた名探偵!工藤新一VS怪盗キッド」放送。ジョディや新出先生と偶然乗り合わせたバスで事件が起こる230・231話「謎めいた乗客」なども。
アニオリの出来事…JR西日本タイアップのミステリーツアー回がこの年から開始。ツアー参加者とコナンたちが観光地で謎解き!
- 監督:山本泰一郎
- OP:恋はスリル、ショック、サスペンス/愛内里菜(205〜230話)destiny/松橋未樹(231〜258話)Winter Bells/倉木麻衣(259〜270話)
- ED:Start in my life/倉木麻衣(219〜232話)always/倉木麻衣(233〜247話)青い青いこの地球に/上原あずみ(248〜265話)
- 劇場版:「天国へのカウントダウン」

NY事件――よみがえる、雨の日の記憶
剣道大会・大阪城の事件の謎に服部が挑む263話「大阪ダブルミステリー 浪花剣士と太閤の城」、ベルモットがなぜ蘭や新一を特別に思っているのか?そのきっかけが判明する286〜288話「工藤新一NYの事件」放送。
アニオリの出来事…妃英理がメインの「法廷の対決」シリーズ初回が放送!
- 監督:山本泰一郎
- OP:Winter Bells/倉木麻衣(259〜270話)I can’t stop my love for you♥/愛内里菜(271〜305話)
- ED:青い青いこの地球に/上原あずみ(248〜265話)夢みたあとで/GARNET CROW(266〜287話)無色/上原あずみ(288〜299話)Overture/稲葉浩志(B’z)(300〜306話)
- 劇場版:「迷宮の十字路」

連続爆破事件を防げるか!?
連続爆破事件の犯人と対決する2時間SP・304話「揺れる警視庁」、板倉の日記データから組織と接触しようとする309~311話「黒の組織との接触」放送。333話から監督が佐藤真人さんに。
アニオリの出来事…警察や組織関連の原作回が多め、アニオリ回少なめのシーズン。
- 監督:山本泰一郎、佐藤真人(333話〜)
- OP:I can’t stop my love for you♥/愛内里菜(271〜305話)風のららら/倉木麻衣(306〜332話)君と約束した優しいあの場所まで/三枝夕夏 IN db(333〜355話)
- ED:Overture/稲葉浩志(B’z)(300〜306話)明日を夢見て/ZARD(307〜328話)君という光/GARNET CROW(329〜349話)
- 劇場版:「ベイカー街の亡霊」

満月の夜、対するは黒ずくめの組織
新一宛に船上パーティーの招待状が届き、組織と対決する2時間半SP「黒の組織と真っ向勝負 満月の夜の二元ミステリー」放送。356話から、キャラクターデザインが須藤昌朋さん→とみながまりさんに。
アニオリの出来事…扇澤さんのシリアス脚本回に注目。
- 監督:佐藤真人
- OP:君と約束した優しいあの場所まで/三枝夕夏 IN db(333〜355話)START/愛内里菜(356〜393話)
- ED:君という光/GARNET CROW(329〜349話)眠る君の横顔に微笑みを/三枝夕夏 IN db(350〜370話)忘れ咲き/GARNET CROW(376〜390話)
- 劇場版:「銀翼の奇術師」

コナン=新一?疑惑を持った蘭は…
蘭がコナンのケータイからある疑いを!?原作エピソードにアニメオリジナルエピソードを足した400話「疑惑を持った蘭」放送。車のナンバーをめぐる回想シーンが楽しい。
アニオリの出来事…「あるキャラ」が唯一登場する418話「米花町グルニエの家」が必見!
- 監督:佐藤真人
- OP:START/愛内里菜(356〜393話)星のかがやきよ/ZARD(394〜414話)Growing of my heart/倉木麻衣(415〜424話)
- ED:忘れ咲き/GARNET CROW(376〜397話)ジューンブライド~あなたしか見えない~/三枝夕夏 IN db(398〜406話)世界 止めて/竹井詩織里(407〜416話)Thank You For Everything/竹井詩織里(417〜424話)
- 劇場版:「水平線上の陰謀」

アナウンサーと謎の少年。暗殺計画を阻止しろ!
人気アナウンサー・水無怜奈が登場し、コナン・ジョディが彼女の動向を探る425話「ブラックインパクト! 組織の手が届く瞬間」放送。429話「もう戻れない二人」で本堂瑛祐が蘭たちのクラスに転入してくる。
アニオリの出来事…全体的に渋め・ハードボイルドなアニオリ回が多め。劇場版は10周年。
- 監督:佐藤真人
- OP:衝動/B’z(425〜437話)100もの扉/愛内里菜&三枝夕夏(438〜456話)雲に乗って/三枝夕夏 IN db(457〜474話)
- ED:悲しいほど貴方が好き/ZARD(425〜437話)もう君だけを離したりはしない/上木彩矢(438〜458話)白い雪/倉木麻衣(459〜470話)
- 劇場版:10周年記念作「探偵たちの鎮魂歌」

工藤新一の解いてきた謎
新一の少年時代を描く472・473話「工藤新一少年の冒険」、孤島でテレビ企画・探偵甲子園に参加する479話「服部平次との3日間」、新一と服部がそれぞれ同じ事件を推理する1時間SP・490話「服部平次VS工藤新一 ゲレンデの推理対決」放送。
アニオリの出来事…初の試み、現実とアニメがリアルタイム進行の478話「リアル30ミニッツ」放送!
- 監督:佐藤真人
- OP:雲に乗って/三枝夕夏 IN db(457〜474話)涙のイエスタデー/GARNET CROW(475〜486話)グロリアス マインド/ZARD(487〜490話)
- ED:白い雪/倉木麻衣(459〜470話)I still believe~ため息~/滴草由実(471〜486話)世界はまわると言うけれど/GARNET CROW(487〜490話)
- 劇場版:「紺碧の棺」

「赤」VS「黒」、その結末は
FBIと組織、昏睡状態のキールを巡る491〜504話「赤と黒のクラッシュ」、謎の大学院生・沖矢昴が登場の509話「赤白黄色と探偵団」放送。505話からキャラクターデザインがとみながまりさん→須藤昌朋さんに戻り、監督が於地紘仁さんに。
アニオリの出来事…アニオリが4回しかなく、一番少ないシーズン。
- 監督:佐藤真人、於地紘仁(505話~)
- OP:愛は暗闇の中で/ZARD(491〜504話)一秒ごとに Love for you/倉木麻衣(505〜514話)Mysterious/Naifu(515〜520話)
- ED:雪どけのあの川の流れのよう/三枝夕夏 IN db(491〜504話)Summer Memories/上木彩矢(505〜514話)GO YOUR OWN WAY/滴草由実(515〜520話)
- 劇場版:「戦慄の楽譜」

容疑者は工藤新一!?
新一が記憶喪失のうえ、殺人事件の容疑者に!?1時間SPの521話「殺人犯、工藤新一」・522話「新一の正体に蘭の涙」、釣りに来た探偵団と沖矢が事件に遭遇する542・543話「魚が消える一角岩」放送。558~561話「死亡の館、赤い壁」で長野県警の諸伏高明が初登場。
アニオリの出来事…色調が明るくなり、明るい話が多めに。
- 監督:於地紘仁
- OP:Revive/倉木麻衣(521〜529話)Everlasting Luv/BREAKERZ(530〜546話)MAGIC/愛内里菜(547〜564話)
- ED:恋心 輝きながら/Naifu(521〜529話)Doing all right/GARNET CROW(530〜539話)光/BREAKERZ(540〜561話)
- 劇場版:「漆黒の追跡者」

現れた火傷の男。その姿は亡霊の如く――
デパートでの爆弾騒ぎの中、死んだはずの赤井秀一の顔をした火傷の男が暗躍する578話「危機呼ぶ赤い前兆」~581話「赤く揺れる照準」放送。事件をきっかけに白鳥警部と小林先生の仲が進展!583話「小林先生の恋」~585話「時を超える桜の恋」なども。
アニオリの出来事…ミステリーツアー回以外すべて1話完結のシーズン。
- 監督:於地紘仁
- OP:MAGIC/愛内里菜(547〜564話)As the Dew/GARNET CROW(565〜582話)SUMMER TIME GONE/倉木麻衣(583〜601話)
- ED:Hello Mr. my yesterday/Hundred Percent Free(562〜587話)Tomorrow is the last Time/倉木麻衣(588〜601話)
- 劇場版:「天空の難破船」

新一、憧れの英国でついに告白…!?
新一からのバレンタインのお返しは?608・609話「裏切りのホワイトデー」、ロンドンに招待され、芝の女王・ミネルバを狙う事件を止めるために暗号に挑む!616~621話「ホームズの黙示録」放送。一時的に新一の姿に戻り、蘭へついに告白…!
アニオリの出来事…アニオリ初の三話連続!603~605話「降霊会W密室事件」放送。劇場版15周年記念作上映。
- 監督:於地紘仁、山本泰一郎(680話~)
- OP:tear drops/Caos Caos Caos(602〜612話)Don’t Wanna Lie/B’z(613〜626話)Misty Mystery/GARNET CROW(627〜641話)
- ED:十五夜クライシス~君に逢いたい~/Hundred Percent Free(602〜609話)月夜の悪戯の魔法/BREAKERZ(616〜620話)ピルグリム/B’z(627〜628話)Your Best Friend/倉木麻衣(629〜643話)
- 劇場版:「沈黙の15分」

3人の「バーボン」候補。絡み合うそれぞれの思惑
646・647話「幽霊ホテルの推理対決」で女子高生探偵・世良真純が、667・668話「ウェディングイブ」で探偵・安室透が初登場。組織のメンバー「バーボン」は世良・安室・沖矢の中に?謎が深まる671~674話「探偵たちの夜想曲(ノクターン)」放送。
アニオリの出来事…おなじみの脚本家以外に新規の脚本家が増え始めるシーズン。
- 監督:於地紘仁、山本泰一郎(680話~)
- OP:Miss Mystery/BREAKERZ(642〜666話)君の涙にこんなに恋してる/なついろ(667〜680話)
- ED:Your Best Friend/倉木麻衣(629〜643話)悲しいほど 今日の夕陽 きれいだね/grram(644〜653話)オーバーライト/BREAKERZ(654〜666話)恋に恋して/倉木麻衣(667〜686話)
- 劇場版:「11人目のストライカー」

真実へと近づくベルツリー急行殺人事件――
小五郎の弟子でポアロの店員・安室透の謎に迫るシーズン。列車内で組織と対決する701~704話「漆黒の特急(ミステリートレイン)」放送。高木刑事が何者かに拉致され、警察やコナンたちが居場所の特定を急ぐ681・682話「命を賭けた恋愛中継」なども。
アニオリの出来事…694話「消えた老舗の和菓子」から、劇場版プレストーリーがテレビ放送に。※「戦慄の楽譜」~「11人目のストライカー」まではOVAが発売
- 監督:山本泰一郎
- OP:TRY AGAIN/倉木麻衣(681〜695話)Q&A/B’z(696〜717話)Butterfly Core/VALSHE(718〜743話)
- ED:恋に恋して/倉木麻衣(667〜686話)瞳のメロディ/BOYFRIEND(687〜704話)君の笑顔がなによりも好きだった/Chicago Poodle(705~721話)
- 劇場版:「絶海の探偵」

揺れる心を狙う黒い影
神社で事件が発生する中、ある人物が暗躍する734・735話「ジョディの追憶とお花見の罠」、最強の防犯システム!京極がキッドと戦う746・747話「怪盗キッドVS京極真」放送。世良と行動を共にする謎の少女が登場し始めるシーズン。731・732話「現場の隣人は元カレ」で交通課の宮本由美の元交際相手・羽田秀吉が初登場。
アニオリの出来事…12月に金曜ロードショー「江戸川コナン失踪事件〜史上最悪の2日間〜」放送。脚本は映画「鍵泥棒のメソッド」の内田けんじ。映画の人物も登場するコラボ作品。
- 監督:山本泰一郎
- OP:Butterfly Core/VALSHE(718〜743話)Greed/KNOCK OUT MONKEY(744〜756話)
- DYNAMITE/倉木麻衣(757〜773話)
- ED:いま逢いたくて…/DAIGO(737~749話)RAIN MAN/AKIHIDE(737~749話)無敵なハート/倉木麻衣(750~762話)
- 劇場版:「異次元の狙撃手」

あの日の真相がついに明らかに!
水族館での新一との思い出と事件を蘭が回想する772・773話「工藤新一水族館事件」、「赤と黒のクラッシュ」の真相が明らかになる779~783話「緋色」シリーズ放送。ラストで組織のNo.2「RUM(ラム)」の名が出てくる。792・793話「三人の第一発見者」で灰原の話から「ラム」が隻眼の人物だと判明。
アニオリの出来事…バラエティ豊かで、話題になったカオス?な回多め。
- 監督:山本泰一郎
- OP:DYNAMITE/倉木麻衣(757〜773話)WE GO/BREAKERZ(774〜789話)謎/La PomPon(790〜803話)
- ED:君への嘘/VALSHE(763〜803話)
- 劇場版:「業火の向日葵」

JKトリオ大活躍♪
安室と蘭・園子・世良・コナンが事件に遭遇する836・837話「仲の悪いガールズバンド」放送。新一がコナンになるまでをリメイクした金曜ロードショー「エピソードONE 小さくなった名探偵」が12月に放送。810~812話「県警の黒い闇」で隻眼の警察官・黒田兵衛が初登場。劇場版20周年!
アニオリの出来事…派手な展開のエンターテイメントな回が多いシーズン。
- 監督:山本泰一郎
- OP:羽/稲葉浩志(804〜816話)世界はあなたの色になる/B’z(817〜844話)
- ED:運命のルーレット廻して/La PomPon(804〜812話)ふたりの秒針/焚吐(813〜826話)SAWAGE☆LIFE/倉木麻衣(827〜842話)YESTERDAY LOVE/倉木麻衣(843〜864話)
- 劇場版:20周年記念作「純黒の悪夢」

思い出すのは、桜とさざ波
新一と蘭の幼稚園での出会いを描いた853・854話「サクラ組の思い出」、新一が小学生の頃に赤井一家と出会う881・882話「さざ波の魔法使い」放送。866・867話「裏切りのステージ」でコナン・安室・沖矢が事件に挑み、回想シーンでスコッチの死の真相が明らかになる。
アニオリの出来事…棺の中や断崖、幽霊館などユニークなシチュエーションでの事件が多いシーズン。
- 監督:山本泰一郎
- OP:幾千の迷宮で 幾千の謎を解いて/BREAKERZ(845〜868話)Lie,Lie,Lie,/大黒摩季(869〜886話)
- ED:YESTERDAY LOVE/倉木麻衣(843〜864話)夢物語/BREAKERZ(865〜876話)渡月橋~君 想ふ~/倉木麻衣(876〜886話)
- 劇場版:「から紅の恋歌」

敵か味方か?謎めいた先生登場
コナンが正体を疑う新任教師・若狭留美が登場の889・890話「新任教師の骸骨事件」、修学旅行編へと繋がる919・920話「JKトリオ秘密のカフェ」、925・926話「心のこもったストラップ」放送。新一は修学旅行に参加できるのか!?
アニオリの出来事…ワールドカップとコラボの907話「Jリーグの用心棒」放送。遠藤選手も登場!
- 監督:山本泰一郎
- OP:Everything OK!!/Cellchrome(887〜902話)カウントダウン/NormCore(903〜915話)タイムライン/dps(916〜926話)
- ED:神風エクスプレス/焚吐×みやかわくん(887〜908話)さだめ/First place(909〜914話)Aozolighter/Cellchrome(915~926話)
- 劇場版:「ゼロの執行人」

待望の修学旅行へ。新一と蘭の恋の行方は?
新一が蘭から告白の返事をもらう、927・928話「紅の修学旅行編」が1時間SPで放送!
941・942話「マリアちゃんをさがせ!」では、黒の組織の「あの方」の正体がついに明らかに…!?そして952~954話「迷宮カクテル」で赤井と安室がついに対峙する!
アニオリの出来事…ギャグに定評のある脚本家・浦沢義雄さんが943話、大和屋暁さんが961話でアニオリ初参加。
- 監督:山本泰一郎
- OP:薔薇色の人生/倉木麻衣(927〜940話)ANSWER/Onlythistime(焚吐×みやかわくん)(941話〜964話)
- ED:きみと恋のままで終われない いつも夢のままじゃいられない/倉木麻衣(928話〜951話)Sissy Sky/宮川愛李(952話〜964話)
- 劇場版:「紺青の拳」

一つの恋が決着!そしてもう一つの恋は…
新型コロナウイルスの影響により、4月公開予定の映画が2021年に延期に。TVアニメが再放送になる影響も。
971~974話「標的(ターゲット)は警視庁交通部」で千葉・苗子の恋に決着が!983・984話「キッドVS高明 狙われた唇」では和葉への告白とキスを狙う服部が動く…!?
アニオリの出来事…年明けに初の4話連続アニオリ「大怪獣ゴメラVS仮面ヤイバー」が放送。アニオリ回の多い年でした。
- 監督:山本泰一郎、山本泰一郎・鎌仲史陽(975話~)
- OP:真っ赤なLip/WANDS(965話〜982話)JUST BELIEVE YOU/all at once(983話〜)
- ED:少しづつ 少しづつ/SARD UNDERGROUND(965話〜976話)
- 劇場版:「緋色の弾丸」(※2021年に延期)

描かれる過去と怪しい瞳
延期になっていた「緋色の弾丸」が一年ずれ込んで上映。「ピアノソナタ『月光』殺人事件」のリメイク版放送、スピンオフコミック『ゼロの日常』『犯人の犯沢さん』アニメ化の発表や『警察学校編』のアニメ化発表・テレビ放送など様々な展開のあった年でした。
アニオリの出来事…2020年よりもアニオリ回は少なめ、原作回多め。
- 監督:山本泰一郎・鎌仲史陽
- OP:JUST BELIEVE YOU/all at once(983話〜999話)ZEROからハジメテ/倉木麻衣(1000話〜1020話)YURA YURA/WANDS(1021話~1032話)
- ED:Reboot/宮川愛李(993話〜1015話)ベロニカ/倉木麻衣(1016話~1028話)SWEET MOONLIGHT/BREAKERZ(1029話~1038話)
- 劇場版:「緋色の弾丸」(※2020年から延期)

- 監督:山本泰一郎・鎌仲史陽
- OP:SLEEPLESS/B’z(1033話〜1048話)SPARKLE/大黒摩季(1049話〜)
- ED:SWEET MOONLIGHT/BREAKERZ(1029話~1038話)空っぽの心/SARD UNDERGROUND(1040話~1057話)プレイメーカー feat.大野雄大(from Da-iCE)/all at once(1058話~)
- 劇場版:「ハロウィンの花嫁」

